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課税口座に移行する際の取得価額は時価で再評価されます。したがって、課税口座に移行した場合、当初の取得価額より低い価額で売却し実際には損となっていても、課税口座移行時に再評価された時価の方が売却した価額より低い場合は、課税されることになります。例えば、120万円で購入した株式投資信託が移行時に時価80万円であった場合、課税口座での取得価額は80万円となり、その後90万円で売却した場合には10万円（90万円- 80万円）の譲渡益が生じたことと見なされ課税されます。